NGS-панели Accel-Amplicon Plus™ от Swift Biosciences помогут выявлению раковых заболеваний

Компания Swift Biosciences сообщила о коммерческом выпуске NGS-панелей Accel-AmpliconPlus™ для выявления раковых заболеваний — набора из девяти опухоспецифичных и узкоспециализированных генетических панелей, предназначенных для таргетированного секвенирования рака. Технология Accel-Amplicon обеспечивает возможность одновременной детекции однонуклеотидных вариаций, копирования нескольких вариаций, а также незначительных включений и удалений для комплексного покрытия участков на экзонов уровне в клинически релевантных генах. Эта методика также позволяет исследователям объединять предварительно проверенный контент и собственные цели к быстром, однопробирочном анализе, создавая таким образом более информативные и гибкие рабочие процедуры в целях достижения своих научных задач.

Каждая опухоль несёт в себе уникальную комбинацию геномных изменений, способных определять темпы роста опухоли и её реакцию на лечение. Таргетированное секвенирование с использованием cфокусированных, мультигенных аналитических панелей представляет собой точный и информативный метод быстрой идентификации клинически значимых вариаций в известных или гипотетических раковых клетках. Однако внедрение онкологических генетических панелей требует опыта в сфере биоинформатики, позволяющего выявлять генетические маркеры и дополнительные ресурсы для создания, оптимизации и проверки анализа.

Accel-Amplicon Plus предоставляет возможность модульного сочетания, что даёт трансляционным лабораториям повышенную гибкость внедрения сразу нескольких стратегий. Лаборатории могут отдать предпочтение обширному набору генов для комплексного профилирования опухолей, а в последствии доработать контент до уровня самых информативных маркеров, или же начать с фокусированного анализа для рутинного скрининга известных и клинических значимых вариаций. Каждый анализ может содержать до 1 500 ампликонов в панели. Все они разработаны и практически проверены специалистами Swift, а также полностью совместимы с размытыми FFPE-образцами или разбавленными пробами жидкостной биопсии.

«Онкологические панели Accel-Amplicon Plus потенциально способны совершить революцию в области исследований рака, — отметил Хэйли Фиске (Haley Fiske), главный коммерческий директор Swift Biosciences. — Объединяя предварительно проверенный и настраиваемый контент в единой панели, клинические исследователи могут извлекать максимальный объём данных из каждого образца опухоли и тем самым ускорять процесс обнаружения и скрининга раковых вариаций».

Онкологические панели Accel-Amplicon Plus включают девять аналитических наборов:

Панели заболеваний: панель колоректального рака Accel-Amplicon Plus™; панель синдрома Линча Accel-Amplicon Plus™; панель рака лёгких Accel-Amplicon Plus™; миелоидная панель Accel-Amplicon Plus™.

Генетические панели: панель общего ракового профилирования 57G Accel-Amplicon Plus™; комплексная генетическая панель ТР53 Accel-Amplicon Plus™; панель генов BRCA1 и BRCA2 Accel-Amplicon Plus™; панель генов BRCA 1, BRCA 2 и PALB 2 Accel-Amplicon Plus™; панель РЭФР Accel-Amplicon Plus™.

В число основных свойств и преимуществ онкологических NGS-панелей Accel-Amplicon Plus входят: панели охватывают тысячи клинически значимых мутаций, содержащихся в базах данных COSMIC и ClinVar, включая встречающиеся в горячих точках мутагенеза, а также на экзоновом и полногеновом уровнях в ключевых генах.

Выявляют аллельную частоту >1% редких вариаций, позволяя идентифицировать зародышевые и соматические мутации в рамках одного анализа

Обеспечивают стабильную производительность и способны работать с расщеплёнными FFPE-пробами весом до 10 нанограмм или ограниченными образцами — например, бесклеточным ДНК, тонкоигольным пунктатом или иными производными малой биопсии

Совместимы со всеми секвенсерами Illumina

Благодаря чрезвычайно информативному контенту. простому протоколу и надёжным результатам, панели подходят для различных сценариев применения в онкологии, включая: обнаружение и подтверждение низкочастотных соматических вариаций; профилирование опухолей в свежих или законсервированных пробах; скрининг на предрасположенность к заболеваниям, ранее выявление и контроль рецидивов; анализ терапевтической эффективности и мониторинг.

Одновременно с выпуском онкологической панели Accel-Amplicon Plus Cancer Panel кампания представила Swift Bioinformatics Resources — ряд коммерческих и общедоступных решений для ускоренного анализа крупных наборов NGS-данных. Первые два инструмента поддерживают процедуру таргетированного секвенирования Swift — это Primerclip™, общедоступный инструмент для обрезания праймера, и FAST Analysis™, программное обеспечение от Genialis для интуитивного выявления вариаций, объединяющее в сфере функции выравнивания, идентификации аллелей и генерирования сводного отчёта.